Mugen là một thương hiệu độ xe quen thuộc của Honda, bên cạnh Modulo cũng rất nổi tiếng. Hãng này chuyên cung cấp các bộ bodykit cho các mẫu xe Honda, từ Civic, Accord cho đến Vezel, và bây giờ Honda City cũng được sở hữu gói nâng cấp này.
Trên thực tế, Honda City không còn được bán tại Nhật nữa, gói nâng cấp của Mugen danh cho các thị trường đang sản xuất mẫu City, và phiên bản lần này chỉ dành riêng cho thị trường Philippines, và phiên bản đặc biệt này chỉ được bán giới hạn 20 xe tại đây.
Gói nâng cấp của Mugen bao gồm bộ bodykit thể thao cho phía trước, phía sau và hai bên, gầm xe sẽ hạ thấp hơn một chút so với nguyên bản. Ngoài ra, Honda City còn sở hữu một cánh hướng gió thể thao phía sau nhô lên cao, giúp tăng cường vẻ đẹp thể thao của City. Lưới tản nhiệt của xe cũng được thay bằng loại năng động hơn, có gẵn sẵn chữ “Mugen”.
Khi ra mắt tại Việt Nam, Honda cũng đã từng trình làng chiếc City gắn sẵn gói độ của Modulo, nhưng dường như nó không được bán ra ngoài thị trường.
Honda City tại Việt Nam được trang bị động cơ 1,5 lít, 16V SOHC, 4 xi-lanh thẳng hàng, kết hợp với hệ thống truyền động 5 cấp cho cả phiên bản số sàn và số tự động. Động cơ sản sinh công suất cực đại 88 kw (120 mã lực) tại số vòng tua 6.600 vòng/phút, mô-men xoắn cực đại 145 Nm tại vòng tua 4.800 vòng/phút. Phiên bản số sàn giá 550 triệu đồng, trong khi bản số tự động giá 590 triệu đồng.

Hoàng Huy